నిర్వాణ చైత్య గా కూడా ప్రసిద్ది చెందిన నిర్వాణ స్థూపం మహాపరినిర్వాణ ఆలయం వెనుక ఉంది. ఈ ఆలయం, 2.74 మీటర్ల ఎత్తు ఉన్న స్థూపం రెండూ ఒకే వేదికమీద వృత్తాకార ఆధారంతో నిలవబడి 15.81 మీటర్ల ఎత్తైన గోపురంతో నిర్మించబడ్డాయి.
ఇటుకలతో తయారుచేసిన ఈ స్థూపం, 1876 లో భారతదేశ మొదటి పురావస్తు సర్వేయరు జనరల్ ఏ.కన్నిన్ఘం నిర్వహించిన త్రవ్వకాలలో ఈ ఆలయంతో పాటు బైటపడింది.
ఇది అదే సంవత్సరం ఏ.సి.ఎల్.కార్లీలే ద్వారా అదే స్థితిలో పునరుధ్ధరించబడింది. ఈ మొత్తం కట్టడం బుద్ధుని పునరావశేషాలకు ఆశ్రయంగా మిల్లాస్ నిర్మించారని నమ్మకం. ఇది అశోక చక్రవర్తిచే మరింత అభివృద్ది చేయబడింది.
బుద్ధుని శిష్యుడైన హరిబాల కుమారగుప్త, గుప్తా రాజవంశ చక్రవర్తి పాలనలో కుషినగర్ లో ప్రస్తుత స్థానంలోని మథుర నుండి స్థూపాన్ని తీసుకువచ్చారని చెప్తారు.
భారతదేశ పురాతత్వ సర్వే వారి తదుపరి త్రవ్వకాలలో బుద్ధుని బూడిద కలిగిన ఒక రాగి పాత్రను కనుగొన్నారు. ఈ పాత్రపై ఉన్న శిలాశాసనాన్ని బట్టి బుద్ధుడు ఈ ప్రదేశంలో బందీగా ఉన్నాడని నిర్ధారించారు.